Asignar cookies en codeigniter

Puedes crear un array con todos los valores que necesites y luego iterarlo con un foreach y realizar el set_cookie:

$cookies = array(
array( 'name' => 'login',
'value' => true,
'domain' => '/',
'secure' => true ),
array( 
'name' => 'usuario',
'value' => 'admin',
'domain' => '/',
'secure' => true ),
array( 'name' => 'password',
'value' => 'admin',
'domain' => '/',
'secure' => true ) );
foreach($cookie in $cookies){ $this->input->set_cookie($cookie); }

Otra alternativa es hacerlo valor por valor con el setcookie:

setcookie('login', true);
setcookie('usuario','prueba');
setcookie('password','prueba');